정혜사 목조삼세불상은 전체적인 형태와 특징 등에서 17세기의 이른 시기에 해당하는 법령스님의 작품으로 추정됨. 중앙에 석가불좌상을 두고(전체 높이 104.8㎝) 우측에는 아미타불(전체높이 97.4㎝), 좌측에는 약사여래불(96.4㎝)을 배치하였음. 나무로 제작하여 그 위에 금을 입힌 목조불상으로 현재 파손된 부분 없이 잘 남아 있음.